Fakultas dan Program yang ada di Universitas Yudharta Pasuruan.
| PROGRAM STRATA SATU (S1) |
| FAKULTAS TEKNIK |
| 1. Teknik Sipil |
| 2. Teknik Mesin |
| 3. Teknik Industri |
| 4. Teknik Informatika |
| FAKULTAS PERTANIAN |
| 1. Ilmu dan Teknologi Pangan |
| 2. Teknologi Hasil Perikanan |
| 3. Agribisnis |
| FAKULTAS ILMU POLITIK DAN SOSIAL |
| 1. Administrasi Bisnis |
| 2. Administrasi Publik |
| 3. Ilmu Komunikasi |
| FAKULTAS PSIKOLOGI |
| 1. Psikologi |
| FAKULTAS AGAMA ISLAM |
| 1. Pendidikan Agama Islam |
| 2. Pendidikan Bahasa Arab |
| 3. Ekonomi Islam |
| 4. Ilmu Al-Qur’an dan Tafsir |
| PROGRAM PASCASARJANA (S2) |
| 1. PAI Multikultural |